Udledningen af forurenende stoffer fra selv de mest effektive brændeovne er stadig betydelig, hvis man sammenligner den med røgen fra moderne træfyrede industrianlæg. Det skyldes dels, at industrianlæggene kører med konstant indfødning af brændsel, samtidig med at lufttilførslen styres automatisk. Det giver en konstant høj forbrændingstemperatur og derved en langt mere effektiv forbrænding, end der kan opnås i en brændeovn. Desuden renses røgen i et filter, så der næsten ikke slipper nogen partikler ud.
F.eks. må en brændeovn ifølge brændeovnsbekendtgørelsen udlede 10 gram partikler pr. kg træ, og kravet til svanemærkede ovne er det halve, hvorimod et industrianlæg må udlede mindre end 0,3 gram. Mange anlæg udleder langt mindre - f.eks. er gennemsnittet for træfyrede kraftvarmeværker omkring 0,1 gram pr. kg træ.
Brændeovnsproducenterne arbejder dog til stadighed på at forbedre forbrændingseffektiviteten, ligesom der arbejdes på udvikling af forskellige teknologier til at reducere forurening i røgen fra brændeovne og brændekedler, så fremtidens ovne vil forurene endnu mindre.
Se også: Brændefyrings bidrag til luftforurening.